全ゲノム情報から新興病原細菌-アルジェンテウス菌の病原性ポテンシャルを評価する

从全基因组信息评估新出现的致病菌 Argenteus 的致病潜力

基本信息

批准号：
20K18927
负责人：
若林友騎
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Osaka Institute of Public Health
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K18927/
关键词：
Staphylococcus argenteus 全ゲノム解析全ゲノムシークエンス病原性

项目摘要

Staphylococcus argenteusは2015年に新種登録された新興病原細菌であり、皮膚軟部組織感染症や敗血症の起因菌である。臨床検体由来株の解析は国内外で相次いで報告されている一方で、食品や健康人手指といった非臨床検体由来株の解析は進んでいない。本研究では、保有する食品・健康人手指・環境由来株の全ゲノム配列を解読し、ゲノム情報から本菌の病原性の評価を試みる。昨年度までの研究で、S. argenteusは、遺伝的に近縁な菌種であるS. aureusと比較して、一部の表現型で差が認められることが明らかになった。本年度は、S. argenteusの遺伝的特性を明確にするために、比較対照として、S. aureusの全ゲノム配列を解読した。これまでに健康人手指や調理環境由来の50株について解読を完了した。また、文献情報等を整理し、パンゲノム解析に使用する病原因子遺伝子データベースの整備を進めている。

Argenteus葡萄球菌是一种新兴的致病细菌，于2015年注册，是软组织感染和败血症的原因。虽然对日本和国外的临床标本菌株的分析进行了据报道，但对诸如食品和健康手指等非临床标本的菌株的分析尚未进行。在这项研究中，我们将解释我们所携带的食物，健康手指和环保菌株的整个基因组序列，并尝试使用基因组信息来评估该细菌的致病性。直到去年的研究表明，与金黄色葡萄球菌（一种遗传相关的物种）相比，某些表型中的阿根链球菌在某些表型中有所不同。今年，将金黄色葡萄球菌的整个基因组序列被解密，以阐明甲状腺葡萄球菌的遗传特征。到目前为止，我们已经完成了从健康的手指和烹饪环境中衍生出的50株解密。此外，我们正在组织文档信息，并开发用于pangenome分析的致病基因数据库。

项目成果

期刊论文数量（5）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

新興食中毒起因菌Staphylococcus argenteusの分子疫学

新出现的食物中毒细菌银葡萄球菌的分子流行病学

DOI：
发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
0
作者：
福田昭;臼井優;若林友騎
通讯作者：
若林友騎

Isolation and characterization of Staphylococcus argenteus strains from retail foods and slaughterhouses in Japan

DOI：
10.1016/j.ijfoodmicro.2021.109503
发表时间：
2022-02-16
期刊：
INTERNATIONAL JOURNAL OF FOOD MICROBIOLOGY
影响因子：
5.4
作者：
Wakabayashi, Yuki;Takemoto, Kohei;Miyake, Masami
通讯作者：
Miyake, Masami

日本のStaphylococcus argenteus分離株の性状解析

日本银白色葡萄球菌分离株的表征

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
綿貫聡 ;仲田和正 ;生坂政臣 ;南学 ;砂川恵伸 ;岩田充永 ;藤沼康樹 ;萩野昇;若林友騎
通讯作者：
若林友騎

食品及び調理環境におけるStaphylococcus argenteusの分布状況と分離菌株の性状

银葡萄球菌在食品和烹饪环境中的分布状况及分离菌株特征

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
若林友騎;山本知佳;岡朋宏;上野純代;小竹幸子;久米田裕子;川津健太郎;三宅眞実
通讯作者：
三宅眞実

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通讯作者：
成谷宏文，玉井栄治，桑原知巳