Does the intestinal flora affect glucose tolerance? -Comparative study of high HbA1c and normal areas

肠道菌群会影响糖耐量吗？

基本信息

批准号：
21K11011
负责人：
鈴木良雄
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Juntendo University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

2021年度に千葉県銚子市で収集した糞便検体について腸内細菌叢の分析を行った。各検体から10,000 read の16S rRNAのアンプリコンをアノテーションし全体で10門、192属、488種の細菌を同定し構成比を得た。検体内の菌の多様性を示すα-多様性（Speciesレベル）は、Observed, Chao1, ACE, Fisher のいずれの指標もHbA1c高値群（5.6%以上; H群）の方が正常群（5.5%以下; N群）より有意に小さかった。また、検体間の菌叢距離を示すβ-多様性（Speciesレベル）はBray-Cutis index,Jensen-Shannon Divergence, Jaccard index のいずれの指標でもH群とN群の間には有意な違いがあった。Genusレベルで比較すると、N群の方がH群よりも有意に多い菌はGordonibacter, Catenibacillus などの15属、有意に少ない菌はFusobacterium, Bacteroides などの4属であった。Speciesレベルで比較すると、N群の方がH群よりも有意に多い菌はAlistipes_putredinis, Anaerostipes_hadrus などの31種、有意に少ない菌はLachnospiraceae_bacterium_9_1_43BFAA9, Catenibacillus_scindens などの9種であった。また、腸内細菌叢（Species）を説明変数としてH群とN群を分類するよう ortho PLS-DAを行ったところ、N群とH群を綺麗に分類することができた。このとき VIP score の上位5菌種は、大きい方からGordonibacter_pamelaeae (N群 > H群)、Bacteroides_sp__Smarlab_3302398(N群 > H群)、Ruminococcus_sp__14531(N群 > H群)、Lachnospiraceae_bacterium_8_1_57FAA(N群 > H群)、Lachnospiraceae_bacterium_9_1_43BFAA(N群 < H群)であった。

我们对 2021 年在千叶县铫子市采集的粪便样本进行了肠道菌群分析。我们注释了每个样本中 10,000 个 16S rRNA 扩增子的读数，总共鉴定了 10 个门、192 个属、488 个细菌种，并获得了它们的组成比。关于表示样本中细菌多样性的α-多样性（物种水平），Observed、Chao1、ACE、Fisher所有指标均显示高HbA1c组（5.6%以上；H组）高于正常组组（5.5%）以下；此外，H组和N组之间的β多样性（物种水平）没有显着差异，β多样性表明样本之间的细菌菌群距离，使用Bray-Cutis指数、Jensen-Shannon散度和Jaccard Ta指数。在属水平上比较，N组中有Gordonibacter、Catenibacillus等15个属的数量明显多于H组，而Fusobacter、Bacteroides等4个属的数量明显较少。在种属水平上比较，N组中有31种细菌丰度显着高于H组，如Alistipes_putredinis和Anaerostipes_hadrus，而Lachnospiraceae_bacteria_9_1_43BFAA9和Catenibacillus_scindens等9种细菌明显较少。此外，当我们使用肠道菌群（物种）作为解释变量进行正交 PLS-DA 对 H 组和 N 组进行分类时，我们能够清楚地对 N 组和 H 组进行分类。此时，VIP评分前5位的菌种，从高到低依次为Gordonibacter_pamelaeae（N组>H组）、Bacteroides_sp__Smarlab_3302398（N组>H组）、Ruminococcus_sp__14531（N组>H组）、Lachnospiraceae_bacter_8_1_57FAA（N组） > H组），Lachnospiraceae_bacteria_9_1_43BFAA（N组<H组）。