3世代コホート調査を用いた生殖補助技術特有のゲノム遺伝子異常の探索的研究

使用三代队列研究对辅助生殖技术特有的基因组遗传异常进行探索性研究

• 批准号: 21K09487
• 负责人: 菅原 淳史
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K09487/
• 关键词: 生殖補助医療（ART）; 体外受精（IVF）; 顕微授精（ICSI）; 三世代コホート調査; ゲノム変化; 遺伝子異常; 体外受精（IVF）/顕微授精（ICSI）; ゲノムワイド関連解析（GWAS）

今年度は東北メディカル・メガバンク機構UnitC下でART例、非ART例のトリオでの全ゲノム情報を用いて、ART特異的なゲノム異常の探索を行なっている。具体的にはまず、三世代コホート調査の調査票から、親子関係、年齢、妊娠方法(狭義の体外受精か、顕微授精か、それ以外か)などの基本情報を抽出する。その中でも当機構で既に全ゲノム解析が終了しているサンプルが研究の対象になる。現時点では5万人の全ゲノム解析が終了しているが、その中でもトリオ全ての解析が終了したものは1200トリオ程度、また、さらにその中で妊娠方法が明らかになっているものは200トリオ程度に限定される。現在はそれらのトリオを対象に、次世代に受け継がれるde novo 変異を抽出している。抽出したトリオの全ゲノム解析結果に対して、両親から受け継いだもの以外のゲノム変化(de novo変異)の抽出をおこなっている。具体的には、構造異型(欠失、重複、逆位など)を、コピー数変化を元に解析している。さらに、片親性ダイソミーも解析の対象としている。片親性ダイソミーとは、片親由来のアレルが、児の両方のアレルで観察される状態である。片親由来の片方のアレルが複製され児の両方のアレルで確認されるものをアイソダイソミー、片親由来の両方のアレルが児に引き継がれるものをヘテロダイソミーと呼んでいるが、今回は数々の報告から顕微授精が児の分節型の片親性アイソダイソミーを引き起こすのではないかという仮説の上、これらの解析を開始している。

今年，在东北医疗大银行组织 C 部的领导下，我们正在利用来自 3 个 ART 和非 ART 病例的全基因组信息来寻找 ART 特异性的基因组异常。具体来说，首先从三代队列研究问卷中提取亲子关系、年龄、怀孕方式（狭义的体外受精、显微授精等）等基本信息。其中，本机构已完成全基因组分析的样本将成为研究对象。目前，已经完成了5万人的完整基因组分析，但其中仅分析了约1200个三人组，其中仅揭示了约200个三人组的怀孕方法。目前，他们正在针对这些三重奏来提取传递给下一代的从头突变。从提取的三人组的全基因组分析结果中，我们正在提取除从父母遗传的基因组变化（从头突变）之外的基因组变化。具体来说，根据拷贝数变化分析结构变异（缺失、重复、倒位等）。此外，单亲二体性也是分析的主题。单亲二体性是指在孩子的两个等位基因中都观察到来自父母一方的等位基因的情况。当来自父母一方的一个等位基因在孩子的两个等位基因中重复并得到证实时，称为等二体性，而当来自父母一方的两个等位基因都被孩子遗传时，称为异二体性。这次，我们将根据数字进行讨论我们基于显微授精可能导致后代节段性单亲二倍体的假设开始了这些分析。