Does the obesity affect the relationship between serum haptoglobin and cholesterol levels?

肥胖是否影响血清触珠蛋白与胆固醇水平之间的关系？

基本信息

批准号：
20K10571
负责人：
神田芳郎
金额：
$ 2.75万
依托单位：
Kurume University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

ハプトグロビン（HP）HPに加え、隣接するHPR（HP関連遺伝子）の遺伝子多型は血中HP濃度のみならず血中コレステロール濃度と関連しており、この関連に肥満あるいは過体重が影響すること他集団の解析により示唆されたことから、日本人集団を対象とした本研究によりコレステロール代謝におけるHPの役割、肥満や過体重の影響を明らかにしたい。今年度は、多数検体（384プレートに配置されたDNA）に適し、かつ微量検体を対象とした研究に有効な方法の開発をすすめた。なお、昨年度デザインしたprobe-based fluorescence-melting-curve-analysis（プローブを利用した蛍光融解曲線解析）によるHPRに存在するrs2000999の遺伝子型判定法の有効性は遺伝子型が分かっている検体を用いた検討により確認している。この方法をベースに、rs2000999と同様血中HP濃度とコレステロール濃度の両方に強く影響し、東アジアと東南アジア諸国に分布するHP完全欠失アレル（HPdel）の接合性とrs2000999の遺伝子型判定を1度の反応で判定する方法を設計し妥当性を検証した。既に他の方法でHPdelとrs2000999の遺伝子型を決定している日本人サンプルの遺伝子型は、以前決定したものと完全に一致した。また2度実施した解析の結果が同一で、方法の再現性も確認された。1回の反応で融解曲線解析とエンドポイント法の両法を利用した遺伝子型判定の報告は現在までにないが、今回の実験系では可能であり、大規模な関連解析に有効な方法を開発することが出来た。

触珠蛋白（HP）除了HP之外，邻近的HPR（HP相关基因）的遗传多态性不仅与血液HP浓度相关，还与血液胆固醇浓度相关，并且肥胖或超重可能会影响这种关系。在人口分析中，我们希望通过这项针对日本人口的研究来阐明 HP 在胆固醇代谢中的作用以及肥胖和超重的影响。今年，我们致力于开发一种适用于大量样本（DNA排列在384个平板上）并且对微量样本研究有效的方法。去年设计的通过基于探针的荧光熔解曲线分析（使用探针的荧光熔解曲线分析）确定 HPR 中 rs2000999 基因型的方法的有效性已通过使用已知基因型的样品得到证实。调查。基于该方法，我们确定了 HP 完全删除等位基因 (HPdel) 的 rs2000999 的接合性和基因分型，该基因与 rs2000999 一样，强烈影响血液 HP 和胆固醇浓度，并且分布在东亚和东南亚国家。根据反应程度进行判断并验证其有效性。已用其他方法测定HPdel和rs2000999基因型的日本样本的基因型与之前测定的结果完全一致。两次分析的结果也相同，证实了该方法的重现性。迄今为止，还没有在单个反应中同时使用熔解曲线分析和终点方法进行基因分型的报道，但使用该实验系统是可能的，并且我们已经开发了一种对大规模关联分析有效的方法。能够做到。