Elucidation of the egg diapause mechanism of the Teleogryllus emma based on comparative transcriptome analysis

基于比较转录组分析阐明Teleogryllus emma卵滞育机制

基本信息

  • 批准号:
    21K05614
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.66万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2021-04-01 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

成育に不適な季節をやり過ごし、かつ効率的な生殖のために発育ステージを揃える生活史戦略として、休眠性を有する昆虫は多い。日本全域に生息するエンマコオロギは、年一化で内因性の卵休眠を示す。一方、その近縁種であるタイワンエンマコオロギは、主に九州や南西諸島に生息し、年二化かつ非休眠性である。また、母性効果による卵休眠の運命決定を特徴とするマダラスズにも着目した。そこで本研究では、休眠性・非休眠性のコオロギの全ゲノム塩基配列情報に基づいた比較トランスクリプトーム解析により、コオロギ科の卵休眠機構を解明することを目的としている。当該年度は、エンマコオロギ・タイワンエンマコオロギの全ゲノム塩基配列の精緻化と、卵休眠の母性効果を示すマダラスズの全ゲノム塩基配列解読、マダラスズの休眠卵と非休眠卵の比較トランスクリプトーム解析を実施した。エンマコオロギ属2種については、Pacific Bioscience社およびOxford NanoporeTechnologies(ONT)のロングリードシークエンスデータ、IlluminaのショートリードシークエンスデータおよびDovetail GenomicsのOmni-Cデータを用いて、高品質なドラフトゲノムを構築した。マダラスズについては、ONTのロングリードシークエンスデータ、IlluminaのショートリードシークエンスデータおよびDovetail GenomicsのOmni-Cデータを用いたHiRise解析によって、染色体レベルのドラフトゲノムを構築した。タイワンエンマコオロギ(非休眠卵)およびマダラスズ(母性効果による卵休眠)については、染色体レベルのドラフトゲノムに基づく、遺伝子アノテーションが完了した。また、マダラスズの卵休眠の比較トランスクリプトーム解析によって、休眠運命を決定づけるタイミング等が明らかになった。
许多昆虫利用休眠作为一种生活史策略,以度过不适合生长的季节,并调整发育阶段以实现高效繁殖。阎魔蟋蟀生活在日本各地,是一年生动物,并表现出内源性卵滞育。另一方面,其相关物种台湾蟋蟀主要生活在九州和南西群岛,一年两次且非休眠。我们还关注了斑点蛋,其特点是母体效应决定了蛋滞育的命运。因此,本研究的目的是基于休眠和非滞育蟋蟀的全基因组序列信息,通过比较转录组分析来阐明蟋蟀科的卵滞育机制。本财年,我们精炼了炎麻蟋蟀和台湾炎麻蟋蟀的全基因组序列,分析了日本斑蟋蟀卵滞育母体效应的全基因组序列,并对滞育与非滞育卵进行了转录组比较分析。斑点蟑螂。对于蟋蟀属的两个物种,使用来自 Pacific Bioscience 和 Oxford Nanopore Technologies (ONT) 的长读序列数据、来自 Illumina 的短读序列数据以及来自 Dovetail Genomics 的 Omni-C 数据构建了高质量的基因组草案。对于斑点松鼠,我们使用 ONT 的长读长序列数据、Illumina 的短读长序列数据和 Dovetail Genomics 的 Omni-C 数据,通过 HiRise 分析构建了染色体水平的基因组草图。基于染色体水平草图基因组,已完成台湾炎麻蟋蟀(非滞育蛋)和普通斑蟋蟀(因母体效应而滞育的蛋)的基因注释。此外,对斑红甲虫卵滞育的比较转录组分析揭示了决定滞育命运的时间。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
コオロギ科食用種Teleogryllus occipitalisおよびTarbinskiellus portentosusの染色体レベル全ゲノム塩基配列解読
可食用物种 Teleogryllus occipitalis 和 Tarbinskiellus portentosus 的染色体水平全基因组测序
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    三野流斗; 片岡孝介; 内藤健; 由良敬; 朝日透
  • 通讯作者:
    朝日透
最先端コオロギ学 ~世界初! 新しい生物学がここにある~
最尖端的板球科学~世界首创的生物学诞生~
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    野地澄晴(共編著者:片岡孝介;由良敬 他)
  • 通讯作者:
    由良敬 他)
コオロギ科食用種Teleogryllus occipitalisおよびTarbinskiellus portentosusの染色体レベル全ゲノム塩基配列解読
可食用物种 Teleogryllus occipitalis 和 Tarbinskiellus portentosus 的染色体水平全基因组测序
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    三野流斗; 片岡孝介; 内藤健; 由良敬; 朝日透
  • 通讯作者:
    朝日透
コオロギの社会実装に向けた学際的研究
蟋蟀社会实施的跨学科研究
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    片岡孝介
  • 通讯作者:
    片岡孝介
マダラスズおよびシバスズのミトコンドリアDNA全長配列の解読とコオロギ上科における分子系統解析
破译斑点鸟和蓝腹鸟的全长线粒体 DNA 序列以及蟋蟀总科的分子系统发育分析。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    村田光陽 片岡孝介 三野流斗 里村和浩 小倉淳 朝日透 由良敬; 鈴木丈詞
  • 通讯作者:
    鈴木丈詞
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    $ 2.66万
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