Omics analysis of skeletal muscle in a mouse model of disuse muscular atrophy.

废用性肌萎缩小鼠模型中骨骼肌的组学分析。

• 批准号: 21K11736
• 负责人: 三浦 芳樹
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Juntendo University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K11736/
• 关键词: 廃用性筋萎縮; プロテオーム解析; リン酸化; メタボローム解析; プロテオミクス; メタボロミクス

本研究はマウス下肢をギプス固定化した廃用性筋萎縮モデルマウスを用いて、筋萎縮に関わる因子をオミクス解析により明らかにするものである。マウス下肢の片側を固定し、下肢骨格筋を切除し、トリプシン消化後、酸化チタン磁気ビーズを用いてリン酸化ペプチドを精製し、質量分析を行っている。ギプス固定によりリン酸化が最も減少（1/5）した転写活性を抑制するタンパク質は予想される生物学的プロセス(gene onthologyより)としてmuscle filament slidingやsarcomere organizationが上位にリストされた。また予想されるマウスの表現型(Mouse Genome Informaticsより)としてmyopathy, muscle_degenerationが上位にランキングされることより、本タンパク質のリン酸化の変動と筋萎縮と非常にかかわりが深いことが示唆された。メタボローム解析に於いては、ギプス固定肢由来の骨格筋とフリーの骨格筋の同一個体での比較を行っているが、24時間と短いためか、マウス間で共通して変動する代謝物の同定には至っていない。

本研究使用下肢固定在石膏中的废用性肌肉萎缩模型小鼠，并利用组学分析来阐明与肌肉萎缩相关的因素。固定小鼠下肢的一侧，切除下肢骨骼肌，胰蛋白酶消化后，使用氧化钛磁珠纯化磷酸化肽并进行质谱分析。肌丝滑动和肌节组织被列为抑制转录活性的蛋白质的最预测的生物过程（来自基因本体论），其磷酸化由于石膏固定而降低最多（1/5）。此外，肌病和肌肉退化与预期的小鼠表型（来自小鼠基因组信息学）一样排名靠前，表明该蛋白质磷酸化的变化与肌肉萎缩密切相关。在代谢组分析中，我们比较了同一个体中来自固定肢体的骨骼肌和游离骨骼肌，但也许由于 24 小时的时间较短，我们无法识别小鼠之间通常存在波动的代谢物。尚未实现。