空間的トランスクリプトーム解析によるCAF誘導性大腸癌免疫リモデリング機構の解明

通过空间转录组分析阐明CAF诱导的结直肠癌免疫重塑机制

基本信息

批准号：
21K08713
负责人：
佐田政史
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

転移・再発大腸癌の治療成績は不良で、予後向上のためには転移・再発機序の詳細な分子細胞学的基盤の解明が必要である。癌の維持・進展における腫瘍微小環境の間質細胞や免疫細胞の細胞間ネットワークや分子基盤が明らかになってきているが、癌関連線維芽細胞(CAF)が腫瘍免疫応答に与える影響は未だ不明な点が多い。腫瘍免疫抑制性のCAFサブセットを制御する、あるいは免疫促進性のCAFサブセットを誘導することが可能となれば、再発・転移性大腸癌治療における大きなブレイクスルーとなることが期待される。本研究では、CAFの機能的なheterogeneityが導く免疫リモデリング機構を、大腸癌組織の空間的トランスクリプトーム解析を足掛かりに解明することを目的とする。本年度は、大腸癌組織を採取し、シングルセル解析を行った。特にCAFや免疫細胞についての解析を行い、複数の大腸癌組織における腫瘍内や正常部位のfibroblast、免疫細胞の機能的なheterogeneityを明らかにした。すでに大腸癌を含む消化器固形癌100例を超えるライブラリー作成をしている。大腸癌以外の固形癌とのCAF、免疫細胞の比較も可能である。解析はRパッケージSeuratを用いて行っており、単一細胞由来のRNA発現からその細胞集団の特徴や機能に着目した解析や、分化の方向性を調べる疑似系譜解析、細胞間相互作用の解析などを行っており、大腸癌の免疫微小環境における様々な免疫細胞やCAFの役割を明らかにしている。また、樹立したオルガノイドとの共培養に用いることを目的として、採取した大腸癌組織からCAFの樹立も行っており、その手技は確立している。さらに、本研究室では、すでに膵癌オルガノイドの樹立に成功しており、その手技に倣って大腸癌でもオルガノイドの樹立を目指す。

过渡和复发的结直肠癌的治疗很差，为了改善预后，有必要阐明转移和复发机制的详细分子细胞基础设施。肿瘤显微镜和免疫细胞在癌症的维持和进展中的间隙细胞网络和分子基础结构已显示出来，但是与癌症相关的成纤维细胞（CAF）对肿瘤免疫反应的影响仍然未知。。如果可以控制肿瘤免疫抑制CAF子群或诱导免疫CAF子集，则可以预期它将是复发和转移性结直肠癌的重大突破。在这项研究中，目的是阐明由CAF的功能异质性作为立足点领导的免疫重塑机制。今年，收集了一个结肠癌组织，并进行了单个细胞分析。特别是，我们分析了CAF和免疫细胞，以阐明多种结直肠癌组织中肿瘤和正常部位的成纤维细胞，以及免疫细胞的功能异质性。该公司已经创建了一个具有100多种消化固体癌症的图书馆，包括结直肠癌。除了结直肠癌以外，还可以将CAF和免疫细胞与其他固体癌进行比较。分析是使用单个细胞衍生的RNA表达的R封装Seurat进行的，该分析的重点是细胞的特征和功能，使用分化方向的化名分析以及细胞间间的分析在结直肠癌的免疫小小的环境中进行各种免疫细胞和CAF。此外，为了与已建立的类器官一起用于培养，CAF是根据收集到的结直肠癌组织建立的，并且已经建立了该程序。此外，该实验室已经成功建立了胰腺癌的器官，并旨在按照手术在结直肠癌中建立类器官树。