糖脂質代謝異常にフォーカスした多層オミックス解析による糖尿病関連肝発癌機構の解明
通过关注糖脂代谢异常的多层组学分析阐明糖尿病相关肝癌发生机制
基本信息
- 批准号:21K07896
- 负责人:
- 金额:$ 2.66万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:2021
- 资助国家:日本
- 起止时间:2021-04-01 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
HBV、HCV感染のない非肝炎ウイルス性肝癌患者が増加しているが、これらの患者の多くは、糖・脂質代謝異常をはじめとする生活習慣病を合併していることが判明している。一方、これらの患者における肝発癌機構は不明な点が多く、肝発癌高リスク症例を効率的に囲い込むスクリーニング法は確立されていない。また、これまでのヒトゲノム、がんゲノム、エピゲノム、トランスクリプトの網羅的研究では、十分に明らかにすることができなかった非ウイルス性肝発癌機構について、本研究では、糖・脂質代謝異常に関連の深いメタボローム、リピドーム、そしてメタゲノム情報を追加して、これまでに蓄積された複数のオミックス情報を統合することで、その一端を明らかにすることを目指し、非肝炎ウイルス性肝発癌高リスク群の囲い込みに有用なバイオマーカー同定など、臨床応用に資する成果の創出を目指している。初年度に引き続き、解析対象症例、臨床情報の集積および検体の選定を行った。2型糖尿病を有する症例について、糖尿病罹病期間、治療内容、肝線維化や脂肪肝の程度などの臨床情報を集積し、肝発癌の有無により、層別化した。また、これらの対象症例の糞便検体を収集して、DNAを抽出した。抽出したDNAを用いて、順次、腸内細菌叢解析を進めている。具体的には、PCR反応で16S rRNAの標的配列を増幅し、次世代シークエンサーで塩基配列を決定した。可変領域の相同性を細菌データベースの参照配列に照らし、分類・同定を行い、組成比を評価している。さらに、血液検体を質量分析装置にかけて、メタボロミクス解析およびリピドミクス解析を進めている。
没有HBV或HCV感染的非肝炎病毒肝癌患者数量越来越多,但是已经发现,其中许多患者患有与生活方式相关的疾病,包括葡萄糖和脂质代谢的异常。另一方面,在这些患者中,肝癌发生机制有许多未知的方面,并且没有建立筛查方法来有效地封闭了肝癌的高危病例。 Furthermore, the mechanisms of non-viral hepatocarcinogenesis, which could not be fully clarified in previous comprehensive studies of human genomes, cancer genomes, epigenomes, and transcripts, have been unable to fully clarify.This study aims to clarify one of the factors by adding metabolome, lipidome, and metagenomic information closely related to glucose and lipid metabolism异常,并整合到迄今为止积累的多个OMIC信息,并创建对临床应用有用的结果,例如鉴定生物标志物,可用于封闭具有病毒性肝癌的高风险基团有用。在第一年之后,收集待分析的病例并选择了标本。对于2型糖尿病的病例,收集临床信息,例如糖尿病疾病的持续时间,治疗细节以及肝纤维化和脂肪肝的程度,并根据肝癌的存在或不存在分层。另外,收集了这些靶病例的粪便标本,并提取DNA。使用提取的DNA,肠道微生物组分析正在接一个地进行。具体而言,通过PCR反应扩增16S rRNA的目标序列,并使用下一代序列确定碱基序列。根据细菌数据库中的参考序列对可变区域的同源物进行分类和鉴定,并评估组成比。此外,还将血液标本应用于质谱仪以进行代谢组和脂肪组分析。
项目成果
期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Increasing incidence of non-HBV- and non-HCV-related hepatocellular carcinoma: single-institution 20-year study.
- DOI:10.1186/s12876-021-01884-5
- 发表时间:2021-07-31
- 期刊:
- 影响因子:2.4
- 作者:Nagaoki Y;Hyogo H;Ando Y;Kosaka Y;Uchikawa S;Nishida Y;Teraoka Y;Morio K;Fujino H;Ono A;Nakahara T;Murakami E;Yamauchi M;Okamoto W;Kawaoka T;Tsuge M;Hiramatsu A;Miki D;Imamura M;Takahashi S;Chayama K;Aikata H
- 通讯作者:Aikata H
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- DOI:
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- 期刊:
- 影响因子:0
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- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:長沖祐子;相方 浩
- 通讯作者:相方 浩
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相似海外基金
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$ 2.66万 - 项目类别:
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