Analyse der genetischen Steuerung des Wasserbindungsvermögens durch Bestimmung Merkmals-assoziierter und QTL-Genotyp-assoziierter Expression von Kandidatengenen und deren genomischer Basis

通过确定候选基因的性状相关和 QTL 基因型相关表达及其基因组基础来分析水结合能力的遗传控制

• 批准号: 23365950
• 负责人: Professor Dr. Karl Schellander
• 金额: --
• 依托单位: Abteilung Tierzucht und Tierhaltung
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Units
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2005-12-31 至 2008-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/23365950?language=en
• 关键词: Analyse; der; genetischen; Steuerung; des

Für die Fleischqualität ist das Wasserbindungsvermögen (WBV) von großer Bedeutung. Das Projekt zielt auf die Analyse des funktionellen Netzwerkes von Genen zur Steuerung des WBV beim Schwein. Für das Projekt werden kommerziell erhältliche, genomweite Mikroarrays genutzt. Als Targets werden mRNAs von Schweinen, differenziert nach Tropfsaftverlust und Genotypen an zwei QTL-Regionen, die in einem Genomscan der DUPI Ressourcen- Population zuvor auf Sscr5 bzw. Sscr18 identifiziert wurden, verwendet. Merkmals- und QTL-Genotyp-assoziiert exprimierte Kandidatengene werden identifiziert und anschließend untersucht, inwiefern cis- und trans-Genregulation für die Merkmalsausprägung relevant ist. Dazu werden mittels eQTL-Analyse Genomregionen identifiziert, in denen Gene lokalisiert sind, die signifikante Effekte auf das Transkriptionsrate/Expressionsmuster von nach den Array-Analysen ausgewählten Loci ausüben. Kandidatengene, für die die eQTL-Analyse auf cis-wirkende regulatorische DNA Variation hinweist, werden in ihren regulativen Abschnitten charakterisiert, nach SNPs durchforstet und zur Kopplungs- und Assoziationsanalyse genotypisiert.

Für die Fleischqualität ist das Wasserbindungsvermögen (WBV) von großer Bedeutung。 Als Targets mRNAs von Schweinen, differentiert nach Tropfsaftverlust and Genotypen an zwei QTL-Regionen, die in einem Genomscan der DUPI Ressourcen- Population zuvor auf Sscr5 bzw, verwendet.和 QTL-基因型-关联 exprimierte Kandidatengene werden identifiziert, in denen Gene lokalisiert sind, die转录率/表达式必须在阵列分析中发挥重要作用。 Durchforstet und zur Kopplungs- und Assoziations 分析基因型。