Genomweite Analysen zur Kartierung von Genen und zur Vorhersage genomischer Zuchtwerte unter Berücksichtigung von Genoytyp-Umwelt-Interaktionen am Beispiel des Milchrindes

以奶牛为例，考虑基因型与环境的相互作用，进行全基因组分析，绘制基因图谱并预测基因组育种值

• 批准号: 157685882
• 负责人: Professor Dr. Jörn Bennewitz
• 金额: --
• 依托单位: Institut für Tierzucht und Tierhaltung
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2009-12-31 至 2013-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/157685882?language=en
• 关键词: Genomweite; Analysen; zur; Kartierung; von

In dem Forschungsvorhaben werden zunächst Genotyp-Umwelt-Interaktionen (GxU) auf Einzelgen-Ebene beim Milchrind für die Merkmale der Milchleistung und der Eutergesundheit aufgedeckt. Die Identifizierung der GxU erfolgt mit Einzelgen-Reaktionsnorm-Modellen und massiven und genomweiten SNP-Markerdaten, welche für ca. 500 nachkommengeprüfte Vererber der Rasse Deutsche Holsteins zur Verfügung stehen. Als Umweltfaktoren werden die Produktionsniveaus der Herden, in der die Töchter der Vererber gehalten werden, definiert. Die Genotypen der Töchter werden durch die der Väter approximiert. Die Verteilung der entdeckten GxU-Effekte werden für die jeweiligen Merkmale und Umwelten abgeleitet und als Input-Parameter für ein stochastisches Simulationsprogramm sowie zur Aufstellung informativer Priors genutzt. Darauf aufbauend werden Modelle zur genomweiten Zuchtwertschätzung mit Berücksichtigung von GxU entwickelt (genomische Selektion mit Berücksichtigung von GxU). Favorisiert werden Bayes-Modelle und nichtparametrische Regressionen, welche GxU durch Reaktionsnormen modellieren. Diese Modelle werden mittels stochastischer Simulationen hinsichtlich des Konvergenzverhaltens, des Rechenzeitbedarfs und der Vorhersagekraft genomischer Zuchtwerte geprüft und an realen Daten validiert.

In dem Forschungsvorhaben werden zunächst Genotyp-Umwelt-Interaktionen (GxU) auf Einzelgen-Ebene beim Milchrind for die Merkmale der Milchleistung der Eutergesundheit aufgedeckt. 500 nachkommengeprüfte Vererber der Rasse Deutsche Holsteins zur Verfügung stehen。 der Vererber gehalten werden，定义为 Töchter werden durch die der Väter approximiert。 Sowie zur Aufstellung informativer Priors genutzt。 welche GxU durch Reaktionsnormen modellieren。