Genomweite Analysen zur Kartierung von Genen und zur Vorhersage genomischer Zuchtwerte unter Berücksichtigung von Genoytyp-Umwelt-Interaktionen am Beispiel des Milchrindes

以奶牛为例，考虑基因型与环境的相互作用，进行全基因组分析，绘制基因图谱并预测基因组育种值

基本信息

批准号：
157685882
负责人：
Professor Dr. Jörn Bennewitz
金额：
--
依托单位：
Institut für Tierzucht und Tierhaltung
依托单位国家：
德国
项目类别：
Research Grants
财政年份：
2010
资助国家：
德国
起止时间：
2009-12-31 至 2013-12-31
项目状态：
已结题

来源：
https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/157685882?language=en
关键词：
Genomweite Analysen zur Kartierung von

项目摘要

In dem Forschungsvorhaben werden zunächst Genotyp-Umwelt-Interaktionen (GxU) auf Einzelgen-Ebene beim Milchrind für die Merkmale der Milchleistung und der Eutergesundheit aufgedeckt. Die Identifizierung der GxU erfolgt mit Einzelgen-Reaktionsnorm-Modellen und massiven und genomweiten SNP-Markerdaten, welche für ca. 500 nachkommengeprüfte Vererber der Rasse Deutsche Holsteins zur Verfügung stehen. Als Umweltfaktoren werden die Produktionsniveaus der Herden, in der die Töchter der Vererber gehalten werden, definiert. Die Genotypen der Töchter werden durch die der Väter approximiert. Die Verteilung der entdeckten GxU-Effekte werden für die jeweiligen Merkmale und Umwelten abgeleitet und als Input-Parameter für ein stochastisches Simulationsprogramm sowie zur Aufstellung informativer Priors genutzt. Darauf aufbauend werden Modelle zur genomweiten Zuchtwertschätzung mit Berücksichtigung von GxU entwickelt (genomische Selektion mit Berücksichtigung von GxU). Favorisiert werden Bayes-Modelle und nichtparametrische Regressionen, welche GxU durch Reaktionsnormen modellieren. Diese Modelle werden mittels stochastischer Simulationen hinsichtlich des Konvergenzverhaltens, des Rechenzeitbedarfs und der Vorhersagekraft genomischer Zuchtwerte geprüft und an realen Daten validiert.

最后，我们致力于开发基因型 - 乌姆维尔特 - interaktionen（GXU）等等，该公司对Milchrind产生了特殊影响。除GXU外，该公司还对Einzelgen-Reaktionsnorm-Modellen产生了特殊影响，该公司在SNP-MarkerDaten中具有很强的业务，并且该公司在Holsteins的票房中具有很强的影响力。该公司拥有有关GXU-Effekte Werden的广泛信息，并且在输入参数方面拥有广泛的信息，并且也是知识的来源。先生Genutzt。 Darauf Aufbauend Werden Modelle Zur GenomweitenZuchtwertschätzätzungMitBerücksichtigungvon von gxu Entwickelt（Genomische SelektionMitBerücksichtigungvon GXU）。 forisiert werden贝斯模特和nichtparametrische回归，韦尔奇·gxu durch reaktionsnormen modellieren。 Diese Modelle Werden Mittels Stochastischer模拟了Hinsichtlich des Konvergenzverhaltens，des rechenzeitbedarfs und der vorhersagekraft genomischer zuchtwerte zuchtwertegeprüftundgeprüftund and bealen daten valyerert。